下列案件应当由公安机关直接受理立案侦查的是（ ）。

参考答案: D

参考解析: 本题考察由公安机关管辖的刑事案件范围。《公安机关办理刑事案件程序规定》第十四条：根据刑事诉讼法的规定，刑事案件由公安机关管辖，但下列刑事案件除外：（一）贪污贿赂犯罪，国家工作人员的渎职犯罪，国家机关工作人员利用职权实施的非法拘禁、刑讯逼供、报复陷害、非法搜查的侵犯公民人身权利的犯罪以及侵犯公民民主权利的犯罪案件，经省级以上人民检察院决定立案侦查的国家机关工作人员利用职权实施的其他重大的犯罪案件。同时《中华人民共和国监察法》第十一条第二款规定：监察委员会依照本法和有关法律规定履行监督、调查、处置职责：（二）对涉嫌贪污贿赂、滥用职权、玩忽职守、权力寻租、利益输送、徇私舞弊以及浪费国家资财等职务违法和职务犯罪进行调查，由监察机关管辖。A、B、C项均是国家机关工作人员利用职权实施职务犯罪，都不能选。D项中的钟某涉嫌传染病菌种扩散罪，属于公安机关管辖刑事案件，应当由公安机关直接受理立案侦查。综上，本题选D。